La Pastoral Estudiantil del Colegio Seráfico se encuentra integrada por miembros de la comunidad educativa y tiene como meta esencial trabajar en la promoción, divulgación y vivencia de los ideales y principios del franciscanismo. La meta se logra a través de la participación de los estudiantes, encargados y miembros del personal institucional en diversas actividades, como lo son; convivencias, retiros espirituales, celebraciones religiosas, viacrucis, talleres, entre otros.